במקרים מסוימים, גם לאחר ביצוע טיפול שורש לא ניתן להגיע לריפוי ראוי של הנגע הדלקתי שסביב חוד השורש.
בחלק מהמקרים אף לא ניתן לבצע חידוש של הטיפול בשל המצאות ברגים בתעלות, בגלל אנטומיה שאינה מאפשרת גישה לאזור הנגע, בגלל שמעוניינים להימנע מפירוק שיקומים גדולים ויקרים, כאשר לא ניתן להגיע לאיטום טוב של קצה השורש או כטיפול משלים לזירוז ריפוי לאחר חידוש טיפול שורש.
בכדי לסלק את הדלקת ואת קצה השורש שגם לה מבצעים את הפרוצדורה הנקראת "קיטוע חוד השן" או "אפיסקטומי".
מהלך טיפול אפיסקטומי
הפרוצדורה נעשית תחת הרדמה מקומית, פתיחת "חלון" קטן בחניכיים באזור שליד הנגע, ניקוי המקום, קיטום קצה השורש הבעייתי וסתימת פתח התעלה על ידי חומר סתימה. לאחר מכן נתפרים החניכיים למקומם.
ריפוי ראשוני מושג תוך מספר ימים וריפוי הנגע לאחר מספר חודשים